La edición del mes de junio de la revista japonesa Morning Two, publicada por Kodansha, ha revelado que el manga Material Puzzle recibirá una nueva publicación tras 9 años desde su finalización. Será el propio Masahiro Totsuka quien realizará la nueva serie del manga de Material Puzzle, cuyo lanzamiento está previsto en mayo, por el momento sin más detalles confirmados.
La historia original del manga comienza cuando Mikaze, un niño que vive en un pueblo fronterizo, emprende una aventura para encontrar tres grandes magos y pedirles que salven a su pueblo de una cierta amenaza. Sin embargo, cuando Mikaze encuentra el hogar de los magos, el único de los magos que queda es la niña Aqua. Ella acepta viajar con él de regreso a su pueblo. Sin embargo, en sus viajes, Aqua perece, pero revive de nuevo con una personalidad diferente. Mikaze descubre que las almas de los tres magos Aqua, Tito y Prisela residen en un solo cuerpo, y cambian al revivir el cuerpo cada vez que muere.
El manga original se publicó en la revista Shonen Gangan de Square Enix de 2002 a 2008 y en 20 volúmenes. Totsuka lanzó un manga corto, titulado Material Puzzle: Ayami Shōnen en Shonen Gangan cuando terminó el manga original, que también terminó en el mismo año. Kodansha recientemente ha empezado a publicar el manga original en formato eBook este enero.